Dnia 7.11.2006 członkowie MTO w składzie: Jacek Tyblewski (wiceprezes) i Szymon Wójcik złożyli w Urzędzie Miasta Krakowa dokumenty, w których przedstawione zostały propozycje utworzenia 44 użytków ekologicznych. W 2005 roku zespół naukowców z Instytutu Nauk o Środowisku Uniwersytetu Jagiellońskiego, zajmujący się od kilku lat przyrodą Krakowa, opracował „Koncepcję Ochrony Różnorodności Biotycznej Miasta Krakowa”, która dostępna jest TUTAJ w wersji pdf.
Zawarto w niej szereg opracowań dotyczących w sumie 36 terenów wytypowanych ze względu na ich cenne walory przyrodnicze, godne objęcia ochroną. Dalszych 8 terenów wytypowało Małopolskie Towarzystwo Ornitologiczne. Miejsca te, znajdujące się w obrębie granic administracyjnych miasta, powinny być chronione ze względu na unikalne walory przyrodnicze w skali nie tylko lokalnej, ale i całego kraju. W lutym 2007 roku propozycje te również zostały przesłane do poszczególnych rad dzielnic.
Poniżej lista proponowanych użytków ekologicznych:
- Mydlniki – stawy
- Fort Mydlniki
- Dolina Prądnika
- Łąki w Toniach
- Mokradło Górka Narodowa
- Park Leśny Witkowice
- Pasternik
- Zbiorniki wodne w Zesławicach
- Dolina Potoku Węrzynowickiego
- Sikornik
- Las Łęgowy w Przegorzałach
- Łąki na południe od ul. Podgórki Tynieckie
- Łąki w Kostrzu
- Łąki w Pastwiskach
- Starorzecze Koło Tynieckie
- Zalew Zakrzówek
- Szerokie Łąki
- Fort Bodzów
- Kamieniołom Tyniec
- Staw i łąki przy ulicy Janasówka
- Zespół Stawów Szuwarowa
- Staw przy ul. Geologów i forty
- Stawki w Piaskach Wielkich
- Las łęgowy przy stacji PKP Swoszowice
- Mokradło w Bieżanowie
- Staw przy ul. Smoleńskiego
- Staw i tereny podmokłe przy ul. Baryckiej
- Łysa Góra i dolina Wilgi w Lusinie
- Park Zdrojowy i dolina potoku w Swoszowicach
- Starorzecze Wisły i wyspa na Przewozie
- Staw Płaszowski
- Zalew Bagry
- Starorzecze Wisły – Lesisko
- Żwirownia w Przylasku Rusieckim
- Bonarka- Stawy
- Ludwinów
- Ujście Skawinki
- Grodzisko
- Łąki Zadworze
- Staw na Złocieniu
- Dolina Drwinki
- Mokradło w Lesie Borkowskim
- Łąki Kobierzyńskie
- Kompleks Przyrodniczy Nowa Huta
PL 
EN