Pomurnik jest regionalnym czasopismem popularnonaukowym Małopolskiego Towarzystwa Ornitologicznego, który ma formę biuletynu informacyjnego wydawanego raz w roku w wersji papierowej i elektronicznej. Na łamach czasopisma publikowane są sprawozdania z bieżącej działalności Towarzystwa oraz wszelkiego rodzaju artykuły o charakterze naukowym, notatki faunistyczne o znaczeniu regionalnym, polemiki, doniesienia o ciekawych badaniach i ochronie ptaków, a także relacje z wypraw ptasiarskich i recenzje ważniejszych książek o tematyce ornitologicznej. Publikowane prace są recenzowane i obejmują różne dziedziny ornitologii, zwłaszcza z zakresu liczebności, rozmieszczenia, biologii i ekologii ptaków występujących na obszarze działania Małopolskiego Towarzystwa Ornitologicznego (Karpaty, Podkarpacie, Wyżyna Małopolska). Staramy się, by publikowane teksty nawiązywały do jednej z dewiz Towarzystwa – „Badamy – Poznajemy – Chronimy”. W poprzednich numerach były obecne artykuły wpisujące się w te kategorie, ale niekoniecznie we wszystkie, rozdziały zaś nie były wydzielone.
Pierwszy numer Pomurnika ukazał się w 1992 roku i zawierał wyłącznie sprawozdania z działalności, w tym najważniejsze informacje o powstaniu MTO w kwietniu 1992 roku, wyniki liczeń ptaków w okresie jesienno-zimowym i podsumowania danych do Atlasu ptaków lęgowych i zimujących Małopolski. W następnych latach Pomurnik wydawany był bardzo nieregularnie, a kolejne numery ukazały się w 1993, 1998, 1999, 2010, 2011, 2012 i 2013. Można się z nimi zapoznać w Numerach archiwalnych. Inicjatorami powstania i pierwszymi redaktorami czasopisma byli: Bogusław Kozik, Wiesław Król, Grzegorz Sitko i Kazimierz Walasz. Przy tworzeniu i wydawaniu następnych numerów w zespole redakcyjnym działali także: Marcin Faber, Aleksandra Krokos, Aneta Ratyńska, Aneta Śliwka, Stanisław Gacek, Damian Wiehle, Jerzy Wróbel i Czesław Zontek. Obecny skład redakcji i dane kontaktowe podane są w podzakładce Redakcja.